Cuando trabajas con Rocky Linux 9.5 no pasa esto pero si en versiones previas como la 9.2. Cuando haces el más minimo cambio te entrará en modo emergencia y eso supone que un minimo cambio es clonar la máquina por ejemplo.
De modo que para poder entrar en una máquina clonada y saltarnos el modo de emergencia se ha de cambiar en /etc/lvm/lvm.conf la siguiente línea:
# use_devicesfile = 0
Quitando el comentario de la opción y poniéndola a 0.
use_devicesfile = 0
Luego se reinicia y ya tendría que arrancar sin entrar en modo emergencia.